На Хабре написали, как запустить Цивилизацию 3 и другие игры на современных компьютерах в большом разрешении.

Время от времени появляется желание запустить старую часть и окунуться в давно любимый геймплей. Для того, чтобы выйти за рамки стандартных 1024х768, даже не придется модифицировать файлы игры. Всё, что нужно — найти в папке с игрой *.ini-файл настроек и добавить туда одну строку. Если у вас полное издание игры (например, Steam-версия), то это будет файл Sid Meier's Civilization III Complete\Conquests\conquests.ini. Добавьте в него строку «KeepRes=1» и сохраните. После этого игра будет запускаться в том же разрешении, в котором работает ваш рабочий стол: