Если воткнуть обратно оригинальный файл без отключения роботов - то должно запуститься
Если вы не делали бэкап изменяемого файла, но у вас лицензионаая копия Civilization 5 - то вы можете просто в настройках игры в стиме сделать проверку целостности кэша - стим просчитает контрольные суммы файлов и заменит исправленные файлы на правильные, которые он потянет из сети. Тянуть игру полностью он не будет - скачает только те файлы, которые он сочтет битыми