Хм, у меня под рукой только сейвы моего прохода с одним своим городом. Там при основании религии Пророк вносит 4000 очков (логично, 4х1000) и очки Пантеона остаются. Атеизм тоже никуда не уходит... так что чем позже Пантеон и религия (чем больше город растет под Атеизмом), тем сложнее дальнейшая конвертация.