Ещё возможно, что вы неправильно выключали компьютер или свет вырубался и на винчестере образовались сбойные блоки, которые попали на то место, где у вас лежат цивовские файлы - поэтому при проверке контрольной суммы они не сошлись и цива начала выкачивать их заново - потому-что даже в сумме все патчи вряд-ли наберут 972Мб, как вы утверждаете - разве-что только с вышедшими DLC