ИИ разрушит, но только если город огромный, и он улетает далеко в минус по счастью. Тогда он сожжет даже город, в котором будет тонна Чудес света.
Проверено. Еще, если город захватит ГГ, то он его тоже сожжет вообще без вопросов.
В обоих случаях не сработает, если город - столица.

ПС,При наличии модов может меняться. Например Pick`n`mix есть CS rarely raze city - при установке ГГ сперва будут смотреть на счастье и только потом будут думать о разрушении города.