Здоровье понижают ещё и джунгли рядом с городом. Вырубай их нафик.

Строй всякие акведуки, добывай больше разной еды, руби джунгли. Плюс иногда выгоднее попридержать рост города и получить полную производительность с меньшим населением, чем неполную с бо'льшим и больным народом.