Вопрос совсем не глупый, а очень даже актуальный. Надеюсь, наши юнитмейкеры напишут небольшую инструкцию по добавлению моделей в игру.

А по вопросам.

1. Если ты добавишь юнит в оригинальную игру, то это и будет называться модом)
2. - - - вот тут нужна подробная инструкция
3. Это как хочешь. Можешь исользовать новую модель для уже имеющегося юнита, но обычно создают нового.
4. Зависит только от твоих намерений.
5. Автоматически, к сожалению, ничего не добавляется, все - руками.