А разве перед началом миссии нет экрана снаряжения? Вроде, всегда был. Там можно вооружить каждого солдата, который присутствует на базе в момент атаки. Перечень вооружения соответствует тому, что находится на складе, включая произведенное инженерами, но еще не проданное.