Ты все 500m скачал? А другие моды нормально работают?

У меня остался патч 1.03: но он уже не нужен.

Устанавливать надо "сверху", в Civ3\Conquests\Scenarios. Попробуй. Если будет вылетаеть, значит что то не так стоит. Вообще, не то чтобы самый хороший мод. Предыдущий Balancer 3.5 мне больше нравился: юнитов меньше, зато действительно все работает и сбалансировано.